RozstrzygnięteBaza Konkurencyjności2022-14754-101005

Usługę sekwencjonowania następnej generacji genomowego dna -wgs

Intelliseq Sp. z o.o., NIP 6772383205

Oryginał w Bazie Konkurencyjności

Najważniejsze informacje

Termin składania ofert
05.05.2022, 12:00
Data publikacji
28.03.2022
Lokalizacja
Kraków, Małopolskie
Wartość szacunkowa
–
Rodzaj
Usługa / Usługi badawcze
Liczba ofert
3

Kody CPV

73111000-3 · Laboratoryjne usługi badawcze

Usługa sekwencjonowania następnej generacji genomowego DNA

Przedmiot zamówienia stanowi usługa sekwencjonowania 100 próbek genomowego DNA wykonana zarówno w technologii krótkich sparowanych odczytów PE150 (np. Illumina HiSeq lub DNB-seq) jak i długich odczytów (np. Oxford Nanopore Technologies lub równoważnej). Ilekroć w niniejszym zapytaniu lub załącznikach Zamawiający powołuje się na ściśle określony proces, metodę, rozwiązania patentowe lub normy, które w jakikolwiek sposób mogłyby preferować konkretnego Wykonawcę lub ograniczać dostęp do postępowania innym wykonawcom, należy je traktować jako procesy, metody lub normy przykładowe. Zamawiający dopuszcza realizację przedmiotu zamówienia za pomocą równoważnych procesów metod lub norm. W przypadku zaoferowania rozwiązań równoważnych na Wykonawcy spoczywa ciężar udowodnienia, iż odpowiadają one wymaganiom minimalnym wskazanym przez Zamawiającego w treści zapytania lub w załącznikach. W zakresie przedmiotu zamówienia Wykonawca zobowiązany będzie do: a) kontroli jakości próbek DNA, b) przygotowania bibliotek DNA typu PCR-free oraz sekwencjonowania 100 ludzkich genomów (WGS) przy średnim pokryciu 30x, odczyty sparowane o długości 150 bp dające minimum 90Gb danych na próbkę, z wykorzystaniem technologii znakowanych fluorescencyjnie nukleotydów (Illumina lub podobnej), c) przygotowania bibliotek oraz sekwencjonowania 100 ludzkich genomów z użyciem długich odczytów w technologii Oxford Nanopore Technologies (PromethION lub podobnej) dające minimum 90Gb danych na próbkę, d) kontrolę jakości odczytów sekwencjonowania przed udostępnieniem, e) udostępnianie danych poprzez odpowiednio szybki serwer internetowy lub wysyłanie na dyskach. Zamawiający przewiduje w ramach niniejszego postępowania zamówienie podstawowe oraz zamówienie z tytułu prawa opcji. W zakresie zamówienia podstawowego Wykonawca zobowiązany jest wykonać sekwencjonowanie następnej generacji genomowego DNA-WGS dla 100 ludzkich genomów. W ramach zamówienia objętego prawem opcji Wykonawca zrealizuje usługę sekwencjonowania dla 50 ludzkich genomów.

Kraków, Kraków, małopolskie

Kryteria oceny ofert

Kryterium cenowe

Cena - 100% wagi. Zamawiający przyzna wartości punktowe dzieląc wartość oferty z najniższą ceną przez wartość badanej oferty, a następnie mnożąc uzyskaną wartość przez wagę, według formuły: WP= (WONC /WOB) x waga.

Warunki udziału i wymagane dokumenty

Wiedza i doświadczenie

Wykonawca zobowiązany jest wykazać, że w okresie ostatnich trzech lat, a jeżeli okres prowadzenia działalności gospodarczej jest krótszy – w tym okresie, wykonał minimum trzy usługi polegające na realizacji badań w zakresie sekwencjonowania ludzkiego genomu o wartości nie niższej niż 500000,00 zł brutto, z których wykorzystano technologię znakowanych fluorescencyjnie nukleotydów oraz Oxford Nanopore Technologies (PromethION) lub równoważne. Ocena spełniania wymagań minimalnych zostanie dokonana na podstawie wykazu wykonanych usług wraz z dokumentami potwierdzającymi ich należyte wykonanie.

Potencjał techniczny

Wykonawca zobowiązany jest wykazać, że dysponuje lub będzie dysponował urządzeniami umożliwiającymi wykonanie usługi z wykorzystaniem technologii znakowanych fluorescencyjnie nukleotydów oraz Oxford Nanopore Technologies (PromethION). Ocena spełniania wymagań minimalnych zostanie dokonana na podstawie złożonego wykazu wyposażenia zakładu i urządzeń technicznych dostępnych Wykonawcy wraz informacją o podstawie dysponowania tymi zasobami. Wykonawca powinien również stosować w laboratorium normę ISO 13485 oraz certyfikat producenta sprzętu do sekwencjonowania potwierdzający prawidłowe przeszkolenie personelu laboratorium.

Osoby zdolne do wykonania zamówienia

Wykonawca zobowiązany jest wykazać, że powoła i skieruje do realizacji zamówienia zespół złożony z minimum trzech osób posiadających minimum dwuletnie doświadczenie w przygotowaniu bibliotek oraz wysokoprzepustowym sekwencjonowaniu ludzkiego genomowego DNA w technologii długich odczytów (np. Oxford Nanopore Technologies lub podobnej) oraz w technologii krótkich sparowanych odczytów PE150 (np. Illumina HiSeq lub DNB-seq).

Lista wymaganych dokumentów/oświadczeń

Poza oświadczeniem o spełnianiu warunków udziału w postępowaniu Wykonawca składa: 1.1. W celu potwierdzenia spełniania warunku opisanego w pkt. 2 Sekcji VII, Wykonawca składa dokument potwierdzający, że Wykonawca prowadzący działalność gospodarczą jest wpisany do rejestru zawodowego lub handlowego prowadzonego w kraju, w którym Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania – wystawiony nie wcześniej niż 6 miesięcy przed złożeniem. 1.2. W celu potwierdzenia spełniania warunku opisanego w pkt. 3 Sekcji VII, Wykonawca składa wykaz wykonanych usług zawierający informacje dotyczące ich przedmiotu, wartości, odbiorców, dat wykonania, wraz z dowodami potwierdzającymi ich należyte wykonanie, według wzoru stanowiącego Załącznik Nr 5 do Zapytania. 1.3. W celu potwierdzenia spełniania warunku opisanego w pkt. 4 Sekcji VII, Wykonawca składa wykaz narzędzi, wyposażenia zakładu i urządzeń technicznych dostępnych Wykonawcy wraz informacją o podstawie dysponowania tymi zasobami, według wzoru stanowiącego Załącznik Nr 6 do Zapytania. 1.4. W celu potwierdzenia spełniania warunku opisanego w pkt. 5 Sekcji VII, Wykonawca składa wykaz osób skierowanych do realizacji zamówienia wraz z informacjami na temat ich kwalifikacji zawodowych, uprawnień, doświadczenia i wykształcenia niezbędnego do wykonania zamówienia, a także zakresu wykonywanych przez nie czynności oraz informacji o podstawie dysponowania tymi osobami, według wzoru stanowiącego Załącznik Nr 7 do Zapytania. 2. W celu potwierdzenia braku podstaw do wykluczenia z postępowania Wykonawca składa: 2.1. Oświadczenie własne o braku podstaw do wykluczenia z postępowania z powodu konfliktu interesów według wzoru stanowiącego Załącznik nr 4 do Zapytania. 2.2. Odpis lub informację z Krajowego Rejestru Sądowego lub Centralnej Ewidencji i Informacji o Działalności Gospodarczej Rzeczypospolitej Polskiej sporządzony nie wcześniej niż 3 miesiące przed złożeniem. 3. Wykonawca posiadający siedzibę lub adres zamieszkania poza granicami Rzeczypospolitej Polskiej zamiast dokumentu, o którym mowa w pkt. 2.2 powyżej składa dokument lub dokumenty wystawione w kraju, w którym wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania, potwierdzające że nie otwarto jego likwidacji, nie ogłoszono upadłości, jego aktywami nie zarządza likwidator lub sąd, nie zawarł układu z wierzycielami, jego działalność gospodarcza nie jest zawieszona ani nie znajduje się on w innej tego rodzaju sytuacji wynikającej z podobnej procedury przewidzianej w przepisach miejsca wszczęcia tej procedury. 4. Ponadto Wykonawca składa: 4.1. Wypełniony i podpisany Formularz ofertowy sporządzony według wzoru stanowiącego Załącznik Nr 1 do Zapytania. 4.2. Wypełniony i podpisany formularz Kalkulacja Cenowa – Opis Przedmiotu Zamówienia stanowiący Załącznik Nr 2 do Zapytania. 4.3. Pełnomocnictwo. 4.4. W przypadku Wykonawców wspólnie ubiegających się o udzielenie zamówienia, dokument ustanawiający Pełnomocnika do reprezentowania ich w postępowaniu o udzielenie zamówienia albo do reprezentowania ich w postępowaniu i zawarcia umowy w sprawie niniejszego zamówienia publicznego.

Harmonogram realizacji

– - 30.06.2023

–