Jaki jest termin składania ofert w tym ogłoszeniu?

Termin składania ofert nie został precyzyjnie określony w pobranych danych — zweryfikuj termin bezpośrednio w ogłoszeniu źródłowym.

Kto publikuje ogłoszenie i gdzie realizowane będzie zamówienie?

Uniwersytet Medyczny im. Piastów Śląskich we Wrocławiu prowadzi postępowanie, a miejscem realizacji jest Wrocław.

Gdzie znajdę oryginalne ogłoszenie?

Pełne ogłoszenie jest dostępne w oficjalnym źródle (Biuletyn Zamówień Publicznych). Atlas Przetargów prezentuje treść zgodnie z dokumentem źródłowym wraz z linkiem do oryginału.

Zmiana ogłoszenia: 91.2025 Wykonanie analizy transkryptomu na skrawkach tkanek utrwalonych w parafinie na potrzeby… | Wrocław, Dolnośląskie

Zmiana ogłoszenia

Pełna treść zmiany dotyczącej istniejącego postępowania lub zawartej umowy.

Ogłoszenie

Treść ogłoszenia

Pełna treść ogłoszenia podzielona na sekcje. Użyj wyszukiwania lub nawigacji, żeby szybciej przejść do właściwego fragmentu.

1ZamawiającySekcja 1

1.1.) Nazwa zamawiającego: Uniwersytet Medyczny im. Piastów Śląskich we Wrocławiu

1.3.) Krajowy Numer Identyfikacyjny: REGON 000288981

1.4.) Adres zamawiającego:

1.4.1.) Ulica: Wybrzeże Ludwika Pasteura 1

1.4.2.) Miejscowość: Wrocław

1.4.3.) Kod pocztowy: 50-367

1.4.4.) Województwo: dolnośląskie

1.4.5.) Kraj: Polska

1.4.6.) Lokalizacja NUTS 3: PL514 - Miasto Wrocław

1.4.9.) Adres poczty elektronicznej: monika.komorowska@umw.edu.pl

1.4.10.) Adres strony internetowej zamawiającego: www.umw.edu.pl

1.5.) Rodzaj zamawiającego: Zamawiający publiczny - jednostka sektora finansów publicznych - uczelnia publiczna

1.6.) Przedmiot działalności zamawiającego: Edukacja

2Informacje podstawoweSekcja 2

2.1.) Numer ogłoszenia: 2025/BZP 00407744

2.2.) Data ogłoszenia: 2025-09-04

3Zmiana ogłoszeniaSekcja 3

3.2.) Numer zmienianego ogłoszenia w BZP: 2025/BZP 00380782

3.3.) Identyfikator ostatniej wersji zmienianego ogłoszenia: 01

3.4.) Identyfikator sekcji zmienianego ogłoszenia:

SEKCJA IV – PRZEDMIOT ZAMÓWIENIA

3.4.1.) Opis zmiany, w tym tekst, który należy dodać lub zmienić:

4.2.2. Krótki opis przedmiotu zamówienia

1.
Przedmiotem zamówienia jest wykonanie analizy transkryptomu na skrawkach tkanek utrwalonych w parafinie na potrzeby Zakładu Histologii i Embriologii Uniwersytetu Medycznego im. Piastów Śląskich we Wrocławiu.
2.
Krótki opis przedmiotu zamówienia:
Przedmiot zamówienia obejmuje:
1)
Wykonanie analizy molekularnej o rozdzielczości subkomórkowej na skrawkach tkanek FFPE, tkanki w postaci mikromacierzy tkankowych, brak konieczności optymalizacji próbek przed analizą.
2)
Analizę ludzkich tkanek nowotworu piersi z wykorzystaniem systemu do analizy opartego o dedykowane, wysoce specyficzne sondy i odczyt sygnału fluorescencyjnego.
3)
Wykonanie analizy dla minimum 20 skrawków, przeanalizowanie minimum 47cm2 tkanki.
4)
Dla każdej próbki analiza przynajmniej 280 genów ludzkich - gotowy panel sond zaprojektowany i przetestowany przez producenta.
5)
Możliwość dodania do 100 genów do analizowanej puli, w tym możliwość zaprojektowania sond do wykonania izoform, transgenów i translokacji.
6)
Analizę o rozdzielczości subkomórkowej, precyzja lokalizacji transkryptu w płaszczyźnie xy nie gorsza niż 30 nm, dla każdego wykrytego transkryptu muszą być podane współrzędne xyz.
7)
W celu precyzyjnego wykrycia komórek segmentacja oparta na minimum 3 lub 4 poziomowym systemie barwienia: jąder komórkowych i/lub białek błonowych i/lub cytoplazmatycznych i/lub 18S r RNA.
8)
Proces analizy nie może mieć niszczącego wpływu na analizowaną tkankę, aby po zakończeniu analizy była możliwość wykonania barwienia H&E lub immunofluorescencji dokładnie na tym samym, badanym skrawku.
9)
Wykorzystany do analizy system, na podstawie zebranych sygnałów fluorescencyjnych, musi automatycznie wykonywać analizę danych, to znaczy: segmentację i klastrowanie komórek, wykonywanie transkryptów i wizualizowanie ich lokalizacji na tkance, podawanie liczby wykrytych transkryptów. Przeanalizowane dane dostarczone w takiej formie, że nie jest konieczna zaawansowana analiza bioinformatyczna.
10)
Wyniki analizy/badania przygotowywane przez Wykonawcę w formacie nie wymagającym zakupy dodatkowego oprogramowania przez Zamawiającego. Producent systemu do analizy musi udostępniać darmowe, bez limitu licencji, oprogramowanie do wizualizacji, automatycznie przeanalizowanych wyników, które można pobrać bezpośrednio z jego strony internetowej. Oprogramowanie niewymagające dedykowanego komputera o dużej mocy obliczeniowej.
11)
Oprogramowanie do wizualizacji musi również umożliwiać pobranie zdjęcia po barwieniu H&E lub IF i nałożenie na zdjęcie wyników analizy molekularnej.
12)
Przekazywane przez Wykonawcę dane musza być w formacie otwartym, umożliwiającym ich wykorzystanie w innych, komercyjnie dostępnych, oprogramowaniach.
13)
skrojony i nałożony na slajdy materiał może być dostarczony jednorazowo lub etapami w zależności od wymagań wykonawcy, uzyskane wyniki wykonawca będzie dostarczać każdorazowo po zakończeniu partii badań wraz z odesłaniem slajdów ze skrawkami.
14)
Czas na wykonanie przedmiotu zamówienia maksymalnie do dnia 15.12.2025 r. lub do dnia przekazania Zamawiającemu wszystkich wyników badań.
3.
Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia, w tym warunki i zasady realizacji tego przedmiotu zamówienia, określa Wzór umowy (załącznik nr 3 do SWZ).

1.
Przedmiotem zamówienia jest wykonanie analizy transkryptomu na skrawkach tkanek utrwalonych w parafinie na potrzeby Zakładu Histologii i Embriologii Uniwersytetu Medycznego im. Piastów Śląskich we Wrocławiu.
2.
Krótki opis przedmiotu zamówienia:
Przedmiot zamówienia obejmuje:
1)
Wykonanie analizy molekularnej o rozdzielczości subkomórkowej na skrawkach tkanek FFPE, tkanki w postaci mikromacierzy tkankowych, brak konieczności optymalizacji próbek przed analizą.
2)
Analizę ludzkich tkanek nowotworu piersi z wykorzystaniem systemu do analizy opartego o dedykowane, wysoce specyficzne sondy i odczyt sygnału fluorescencyjnego.
3)
Wykonanie analizy dla minimum 20 skrawków, przeanalizowanie minimum 47cm2 tkanki.
4)
Dla każdej próbki analiza przynajmniej 280 genów ludzkich - gotowy panel sond zaprojektowany i przetestowany przez producenta.
5)
Możliwość dodania do 100 genów do analizowanej puli, w tym możliwość zaprojektowania sond do wykonania izoform, transgenów i translokacji.
6)
Analizę o rozdzielczości subkomórkowej, precyzja lokalizacji transkryptu w płaszczyźnie xy nie gorsza niż 30 nm, dla każdego wykrytego transkryptu muszą być podane współrzędne xyz.
7)
W celu precyzyjnego wykrycia komórek segmentacja oparta na minimum 3 lub 4 poziomowym systemie barwienia: jąder komórkowych i/lub białek błonowych i/lub cytoplazmatycznych i/lub 18S r RNA.
8)
Proces analizy nie może mieć niszczącego wpływu na analizowaną tkankę, aby po zakończeniu analizy była możliwość wykonania barwienia H&E lub immunofluorescencji dokładnie na tym samym, badanym skrawku.
9)
Wykorzystany do analizy system, na podstawie zebranych sygnałów fluorescencyjnych, musi automatycznie wykonywać analizę danych, to znaczy: segmentację i klastrowanie komórek, wykonywanie transkryptów i wizualizowanie ich lokalizacji na tkance, podawanie liczby wykrytych transkryptów. Przeanalizowane dane dostarczone w takiej formie, że nie jest konieczna zaawansowana analiza bioinformatyczna.
10)
Wyniki analizy/badania przygotowywane przez Wykonawcę w formacie nie wymagającym zakupy dodatkowego oprogramowania przez Zamawiającego. Producent systemu do analizy musi udostępniać darmowe, bez limitu licencji, oprogramowanie do wizualizacji, automatycznie przeanalizowanych wyników, które można pobrać bezpośrednio z jego strony internetowej. Oprogramowanie niewymagające dedykowanego komputera o dużej mocy obliczeniowej.
11)
Oprogramowanie do wizualizacji musi również umożliwiać pobranie zdjęcia po barwieniu H&E lub IF i nałożenie na zdjęcie wyników analizy molekularnej.
12)
Przekazywane przez Wykonawcę dane musza być w formacie otwartym, umożliwiającym ich wykorzystanie w innych, komercyjnie dostępnych, oprogramowaniach.
13)
skrojony i nałożony na slajdy materiał może być dostarczony jednorazowo lub etapami w zależności od wymagań wykonawcy, uzyskane wyniki wykonawca będzie dostarczać każdorazowo po zakończeniu partii badań wraz z odesłaniem slajdów ze skrawkami.
14)
Czas na wykonanie przedmiotu zamówienia maksymalnie do dnia 15.12.2025 r. lub do dnia przekazania Zamawiającemu wszystkich wyników badań.
15)
Zamawiający w celu realizacji przedmiotu zamówienia, zapewni Wykonawcy odczynniki do analizy transkryptomu na skrawkach tkanek utrwalonych w parafinie firmy 10XGenomiscs.
3.
Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia, w tym warunki i zasady realizacji tego przedmiotu zamówienia, określa Wzór umowy (załącznik nr 3 do SWZ).

3.4.) Identyfikator sekcji zmienianego ogłoszenia:

SEKCJA IX - POZOSTAŁE INFORMACJE

3.4.1.) Opis zmiany, w tym tekst, który należy dodać lub zmienić:

9.1. Informacje dodatkowe

1.
Termin realizacji przedmiotu zamówienia: Wykonawca będzie realizował przedmiot zamówienia w terminie od dnia podpisania umowy do dnia 15.12.2025 r. lub do dnia przekazania Zamawiającemu wszystkich wyników badań, w zależności od tego, które ze zdarzeń nastąpi pierwsze.
2.
Termin realizacji zamówienia został określony datą, z uwagi na konieczność realizacji i rozliczenia dofinansowania w ramach umowy o objęcie wsparciem środków Krajowego Programu Odbudowy nr: 2024/ABM/03/KPO/KPOD.07.07-IW.07-0071/24-00 pn.: „Ocena zmian profilu ekspresji genów zależnych od PIP (prolactin-induced protein) w zależności od podtypu molekularnego raka gruczołu piersiowego w aspekcie odpowiedzi na chemioterapię" - Uniwersytet Medyczny im. Piastów Śląskich we Wrocławiu. Numer projektu: KPOD.07.07-IW.07-0071/24.

1.
Termin realizacji przedmiotu zamówienia: Wykonawca będzie realizował przedmiot zamówienia w terminie od dnia podpisania umowy do dnia 15.12.2025 r. lub do dnia przekazania Zamawiającemu wszystkich wyników badań, w zależności od tego, które ze zdarzeń nastąpi pierwsze.
2.
Termin realizacji zamówienia został określony datą, z uwagi na konieczność realizacji i rozliczenia dofinansowania w ramach umowy o objęcie wsparciem środków Krajowego Programu Odbudowy nr: 2024/ABM/03/KPO/KPOD.07.07-IW.07-0071/24-00 pn.: „Ocena zmian profilu ekspresji genów zależnych od PIP (prolactin-induced protein) w zależności od podtypu molekularnego raka gruczołu piersiowego w aspekcie odpowiedzi na chemioterapię" - Uniwersytet Medyczny im. Piastów Śląskich we Wrocławiu. Numer projektu: KPOD.07.07-IW.07-0071/24.
3.
Przedmiot zamówienia zostanie zrealizowany w trzech etapach, z których dwa pierwsze zakończą się Raportem Częściowym, a ostatni Raportem końcowym:
a) Etap I – analiza 2 szkiełek (4 skrawków tkanki) w terminie 10 dni od dnia otrzymania szkiełek od Zamawiającego,
b) Etap II – analiza 5 szkiełek (10 skrawków tkanki) w terminie 25 dni od dnia otrzymania szkiełek od Zamawiającego,
c) Etap III - analiza 3 szkiełek (6 skrawków tkanki) oraz dodatkowo analizowanych skrawków tkanek utrwalonych w parafinie w przypadku deklaracji Wykonawcy w Formularzu ofertowym, w terminie do 15.12.2025 r.

3.4.) Identyfikator sekcji zmienianego ogłoszenia:

SEKCJA VIII - PROCEDURA

3.4.1.) Opis zmiany, w tym tekst, który należy dodać lub zmienić:

8.1. Termin składania ofert

Przed zmianą:
2025-09-08 09:00

Po zmianie:
2025-09-12 09:00

3.4.1.) Opis zmiany, w tym tekst, który należy dodać lub zmienić:

8.3. Termin otwarcia ofert

Przed zmianą:
2025-09-08 09:15

Po zmianie:
2025-09-12 09:15

3.4.1.) Opis zmiany, w tym tekst, który należy dodać lub zmienić:

8.4. Termin związania ofertą

Przed zmianą:
2025-10-07

Po zmianie:
2025-10-11

Analiza rynku

Typowy budżet zamawiającego w tej kategorii CPV, podobne postępowania oraz historia zamawiającego i rynek lokalny.

Typowy budżet w tej kategorii CPV

Brak kategorii

Brak danych benchmarkowych dla tej kategorii CPV.

W ostatnim roku nie znaleźliśmy wystarczającej liczby podobnych postępowań z podaną wartością szacunkową, żeby policzyć statystyki.

Podobne przetargi

Ta sama kategoria CPV, ostatni rok

Brak danych do porównania.

Historia zamawiającego

Najnowsze postępowania tego podmiotu

Profil →

Brak danych do porównania.

Powiązane lokalnie

Aktywne w tym samym rynku lokalnym

Brak danych do porównania.

Dokumenty i komunikacja

Platforma składania ofert, linki do dokumentacji i dane kontaktowe zamawiającego.

Platforma zakupowa

Miejsce składania ofert lub komunikacji z zamawiającym.

Platforma e-Zamówienia

ezamowienia.gov.pl

Kontakt i komunikacja

E-mail

monika.komorowska@umw.edu.pl

Strona

www.umw.edu.pl

91.2025 Wykonanie analizy transkryptomu na skrawkach tkanek utrwalonych w parafinie na potrzeby Zakładu Histologii i Embriologii Uniwersytetu Medycznego im. Piastów Śląskich we Wrocławiu

Przebieg postępowania

Zmiana ogłoszenia

Treść ogłoszenia

1.4.) Adres zamawiającego:

3.4.) Identyfikator sekcji zmienianego ogłoszenia:

3.4.1.) Opis zmiany, w tym tekst, który należy dodać lub zmienić:

3.4.) Identyfikator sekcji zmienianego ogłoszenia:

3.4.1.) Opis zmiany, w tym tekst, który należy dodać lub zmienić:

3.4.) Identyfikator sekcji zmienianego ogłoszenia:

3.4.1.) Opis zmiany, w tym tekst, który należy dodać lub zmienić:

3.4.1.) Opis zmiany, w tym tekst, który należy dodać lub zmienić:

3.4.1.) Opis zmiany, w tym tekst, który należy dodać lub zmienić:

Analiza rynku

Typowy budżet w tej kategorii CPV

Podobne przetargi

Historia zamawiającego

Powiązane lokalnie

Dokumenty i komunikacja

Platforma zakupowa

Kontakt i komunikacja

Najczęstsze pytania o to ogłoszenie