# Sekwencjonowanie genomowe wraz z usługami dodatkowymi, tj. przygotowaniem bibliotek oraz podstawową analizą bioinformatyczną

Źródło: Atlas Przetargów
Adres kanoniczny: https://atlasprzetargow.pl/przetarg/2025-BZP-00610723
Ogłoszenie źródłowe: https://ezamowienia.gov.pl/mo-client-board/bzp/notice-details/id/08de3ec3-0554-e41d-d6d3-f5000162406c
Stan danych: 2026-10-26
Licencja: CC BY 4.0, cytuj jako "Atlas Przetargów, https://atlasprzetargow.pl/przetarg/2025-BZP-00610723"

**Numer ogłoszenia**: 2025/BZP 00610723
**Rodzaj ogłoszenia**: ogłoszenie o wykonaniu umowy
**Data publikacji**: 2025-12-19
**Zamawiający**: Państwowy Instytut Weterynaryjny - Państwowy Instytut Badawczy (NIP: 7160010761)
**Lokalizacja**: Puławy, woj. lubelskie
**Wartość**: brak potwierdzonej wartości
**Wadium**: brak
**Termin składania ofert**: nie podano
**CPV**: 73111000-3 (Laboratoryjne usługi badawcze)

## Opis
Ogłoszenie nr 2025/BZP 00610723 z dnia 2025-12-19

Ogłoszenie o wykonaniu umowy
Usługi
Sekwencjonowanie genomowe wraz z usługami dodatkowymi, tj. przygotowaniem bibliotek oraz podstawową analizą bioinformatyczną

SEKCJA I - ZAMAWIAJĄCY

1.1.) Nazwa zamawiającego: Państwowy Instytut Weterynaryjny - Państwowy Instytut Badawczy

1.3.) Krajowy Numer Identyfikacyjny: REGON 000080252

1.4) Adres zamawiającego

1.4.1.) Ulica: Al. Partyzantów 57

1.4.2.) Miejscowość: Puławy

1.4.3.) Kod pocztowy: 24-100

1.4.4.) Województwo: lubelskie

1.4.5.) Kraj: Polska

1.4.6.) Lokalizacja NUTS 3: PL815 - Puławski

1.4.9.) Adres poczty elektronicznej: przetargi@piwet.pulawy.pl

1.4.10.) Adres strony internetowej zamawiającego: www.piwet.pulawy.pl

1.5.) Rodzaj zamawiającego: Zamawiający publiczny - osoba prawna, o której mowa w art. 4 pkt 3 ustawy (podmiot prawa publicznego)

SEKCJA II – INFORMACJE PODSTAWOWE

2.1.) Identyfikator postępowania: ocds-148610-96b23090-498f-4aaa-a1b0-916ea1143069

2.2.) Numer ogłoszenia: 2025/BZP 00610723

2.3.) Wersja ogłoszenia: 01

2.4.) Data ogłoszenia: 2025-12-19

SEKCJA III – PODSTAWOWE INFORMACJE O POSTĘPOWANIU W WYNIKU KTÓREGO ZOSTAŁA ZAWARTA UMOWA

3.1.) Charakter zamówienia:

Zamówienie klasyczne - od 130 000 zł, ale o wartości mniejszej niż progi unijne

3.2.) Zamówienie było poprzedzone ogłoszeniem o zamówieniu albo ogłoszeniem o zamiarze zawarcia umowy w BZP lub Dz. Urz. UE: Tak

3.2.1.) Numer ogłoszenia w BZP lub Dz. Urz. UE: 2025/BZP 00436897

3.3.) Czy zamówienie dotyczy projektu lub programu współfinansowanego ze środków Unii Europejskiej:

Nie

3.5.) Tryb udzielenia zamówienia wraz z podstawą prawną:

Zamówienie udzielane jest w trybie podstawowym na podstawie: art. 275 pkt 1 ustawy

3.6.) Rodzaj zamówienia:

Usługi

3.7.) Nazwa zamówienia:

Sekwencjonowanie genomowe wraz z usługami dodatkowymi, tj. przygotowaniem bibliotek oraz podstawową analizą bioinformatyczną

3.8.) Krótki opis przedmiotu zamówienia:

Przedmiotem usługi jest sekwencjonowanie genomowe wraz z usługami dodatkowymi, tj. przygotowaniem bibliotek oraz podstawową analizą bioinformatyczną.

Próbki będą wysłane jednorazowo (planowany termin wysłania próbek: październik-listopad 2025 r.).

Przewidywana ilość prób w czasie trwania umowy będzie wynosiła około 54 próbek.

Minimalne wymagane parametry usługi:
	przygotowanie bibliotek do sekwencjonowania w trybie odczytów dwustronnych (sparowanych), długość insertu miedzy adapterami powinna być tak dobrana, aby umożliwić odczyt o długości 300 pz w każdą stronę;
	sekwencjonowanie genomowe w technologii Illumina, platforma MiSeq w trybie odczytów dwustronnych (pair-end), konfiguracja przebiegu sekwencjonowania 2x300bp;
	sekwencjonowanie z minimalnym pokryciem 70x
	podstawowa analiza bioinformatyczna (przycinanie odczytów, ocena jakości sekwencji, przygotowanie plików wynikowych w formacie fasta oraz danych surowych w formacie fastQ)
	ilość odczytów Q30 powyżej 75%

Do Wykonawcy, w celu wykonania usługi, przesłane będą próbki w postaci materiału genetycznego (DNA bakterii):
- Listeria monocytogenes (wielkość genomu ok. 2,9 Mb) – planowana liczba ok. 7 próbek
- Salmonella spp. (wielkość genomu ok. 4,78 Mb) – planowana liczba ok. 2 próbek
- Yersinia spp. (wielkość genomu ok. 4,6 Mb) - planowana liczba ok. 15 próbek
- Staphylococcus aureus (wielkość genomu ok. 2,8 Mb)- planowana liczba ok. 30 próbek

3.9.) Główny kod CPV: 73111000-3 - Laboratoryjne usługi badawcze

SEKCJA IV – PODSTAWOWE INFORMACJE O ZAWARTEJ UMOWIE

4.1.) Data zawarcia umowy: 2025-11-12

4.2.) Okres realizacji zamówienia:

28 dni

4.3.) Dane wykonawcy, z którym zawarto umowę:

4.3.1.) Nazwa (firma) wykonawcy, któremu udzielono zamówienia (w przypadku wykonawców ubiegających się wspólnie o udzielenie zamówienia – dotyczy pełnomocnika, o którym mowa w art. 58 ust. 2 ustawy): Genomed S.A.

4.3.2.) Krajowy Numer Identyfikacyjny: PL7010083563

4.3.3.) Ulica: Ponczowa 12

4.3.4.) Miejscowość: Warszawa

4.3.5.) Kod pocztowy: 02-971

4.3.6.) Województwo: mazowieckie

4.3.7.) Kraj: Polska

4.4.) Wartość umowy: 40649,04 PLN

4.5.) Numer ogłoszenia o wyniku postępowania zamieszczonego w BZP lub numer ogłoszenia o udzieleniu zamówienia opublikowanego w Dzienniku Urzędowym Unii Europejskiej: 2025/BZP 00534425/01

SEKCJA V PRZEBIEG REALIZACJI UMOWY

5.1.) Czy umowa została wykonana: Tak

5.2.) Termin wykonania umowy: 2025-12-09

5.3.) Czy umowę wykonano w pierwotnie określonym terminie: Tak

5.4.) Informacje o zmianach umowy

5.4.1.) Liczba zmian: 0

5.5.) Łączna wartość wynagrodzenia wypłacona z tytułu zrealizowanej umowy: 39896,28 PLN

5.6.) Czy umowa została wykonana należycie: Tak

5.7.) Podczas realizacji zamówienia zamawiający kontrolował przewidziane w zawartej umowie wymagania:

nie dotyczy

2025-12-19 Biuletyn Zamówień Publicznych | Ogłoszenie o wykonaniu umowy - Zamówienie udzielane jest w trybie podstawowym na podstawie: art. 275 pkt 1 ustawy - Usługi